發光
發光是一個開源項目中創建的磚和Regeneron遺傳學中心之間的協作。在發光特性的更多信息,請參閱發光的文檔。
建立一個發光的環境
上安裝發光磚集群通過碼頭工人磚容器服務。
你可以找到在容器ProjectGlow Dockerhub頁麵。這些設置環境與發光和其他在磚運行時庫,基因組學(棄用)。使用projectglow / databricks-glow: < databricks-runtime-version >,用一個可用的替代標記磚運行時版本。
或安裝這兩種集群庫:
Maven:
io.projectglow: glow-spark3_2.12: <版本>PyPI:
glow.py = = <版本>
重要的
如果你安裝發光作為一個獨立的PyPi包,安裝它集群圖書館,而不是notebook-scoped圖書館使用
%皮普神奇的命令。確保Maven坐標和PyPI包都包括在集群上,每個匹配的版本。
安裝最新版本的發光磚上運行時,沒有磚基因(棄用),運行時的發光v0.6默認安裝。
開始發光
磚建議您運行測試筆記本電腦測試數據提供的筆記本電腦之前,真正的數據。這些筆記本測試夜間發光碼頭工人容器的最新版本。
重要的
檢查點後三角洲湖攝取或轉換的基因型數據。
如果輝光作為一個獨立的PyPi包安裝,請安裝作為一個集群圖書館,而不是作為一個notebook-scoped圖書館使用
%皮普神奇的命令。請包括Maven坐標。不要安裝冰雹集群上發光,除非從冰雹矩陣表中提取數據。