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2022年8月26日更新
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亞當是Apache Spark上用於基因組數據處理的庫。它用於實現操作基因組讀取數據(如BAM、SAM和CRAM文件)的管道。
在Databricks中使用ADAM:
使用這些文件啟動Databricks Runtime集群火花配置:
# Hadoop配置org.apache.spark.serializer.KryoSerializerspark.kryo.registrator org.bdgenomics.adam.serialization.ADAMKryoRegistratorspark.hadoop.hadoopbam.bam。enable-bai-splitter真實
安裝集群庫:
Maven:org.bdgenomics.adam: adam-apis-spark3_2.12: <版本>
org.bdgenomics.adam: adam-apis-spark3_2.12: <版本>
PyPI:bdgenomics.adam
bdgenomics.adam