磚6.6運行時的基因組學(不支持)

磚在2020年5月發布了這張照片。

磚6.6運行時的基因組學是一個版本的磚運行時的6.6(不支持)針對處理基因組和生物醫學數據進行了優化。它是一個組件的磚統一為基因組學分析平台。Beplay体育安卓版本

更多信息,包括指令創建磚基因集群,運行時看到的基因組學導遊。關於開發基因組學應用程序的更多信息,請參閱基因組學導遊。

新功能

磚6.6運行時的基因組學是建立在磚6.6運行時。有什麼新信息的磚6.6運行時,看到的磚運行時的6.6(不支持)發行說明。

的版本發光包括在磚6.6運行時的基因組學可以閱讀GFF3文件。DataFrame模式推斷從目前的屬性。我們增加了這功能在開源的。

我們現在支持自定義參考基因組DNASeq,腫瘤/正常,聯合基因分型管道。

的DNASeq,RNASeq,腫瘤/正常管道現在有一個選項來設置一個樣品超時。

的DNASeq,RNASeq,腫瘤/正常管道出口BAM現在有一個選擇。一致讀可以導出為一個BAM或分片BAMs。

體現的DNASeq,RNASeq,腫瘤/正常,聯合基因分型管道現在可以通過一個blob以及提供路徑。如果通過一個blob提供清單,所有路徑必須是絕對的。

的發光變體標準化者現在接受壓縮參考序列,如block-gzipped FASTA文件。我們增加了這改進在開源的。

的發光管變壓器現在忽略空分區,這樣用戶不再需要輸入DataFrame合並。我們增加了這改進在開源的。

BAMs vcf輸出DNASeq,RNASeq,腫瘤/正常,聯合基因分型管道現在文檔相關的庫版本在他們的頭。

重複閱讀定位階段的標誌DNASeq管道現在速度更快,需要更少的內存。

的genotypeGivenAlleles和emitAllAlleles已經刪除的選項聯合基因分型管道。

以下庫包含在磚6.6運行時的基因不同於那些包含在磚6.6運行時。