磚7.0運行時的基因組學(不支持)
磚這張照片在2020年6月發布。
磚7.0運行時的基因組學是一個版本的磚運行時的7.0(不支持)針對處理基因組和生物醫學數據進行了優化。它是一個組件的磚統一為基因組學分析平台。Beplay体育安卓版本
更多信息,包括指令創建磚基因集群,運行時看到的基因組學導遊。關於開發基因組學應用程序的更多信息,請參閱基因組學導遊。
新功能
磚7.0運行時的基因組學是建立在磚7.0運行時。有什麼新信息的磚7.0運行時,看到的磚運行時的7.0(不支持)發行說明。
GloWGR:全基因組回歸
現在包括一個可伸縮的全基因組回歸方法,GloWGR。GloWGR是單節點的分布式版本的工具regenie。GloWGR是一個企業級工具提供等效精度為全基因組其他方法回歸,但在一個數量級的提高速度。有關詳細信息,請參見全基因組的回歸在開源的。
變形金剛接受non-string類型參數
所有發光的變壓器,包括管變壓器和變體標準化者,現在接受參數的值並不是字符串。的發光管變壓器的文檔反映了新的用法。向後兼容性,字符串值仍接受所有參數。
Numpy ndarray文字
你現在可以通過文字numpy 1 d和2 d浮子式ndarrays預期DataFrame列類型的函數數組<雙>和DenseMatrix分別。的光芒全基因組關聯研究文檔展示了新的用法。
意思是替換函數
現在提供發光mean_substitute函數代替缺失值在數組的均值non-missing值。
改進
聯合基因分型的性能
的性能聯合基因分型管道提高了5 - 20%。改善尤為明顯當使用集群每個節點與許多核心節點類型。
VCF讀者忽略tabix索引文件
在以前的版本中,VCF讀者閱讀VCF的目錄文件時可能會失敗,如果目錄包含tabix索引文件。讀者將試圖解釋tabix文件VCF文件和報告一個錯誤。現在,讀者隻使用索引文件,以確定哪些數據文件讀取。
刪除splitToBiallelic選擇從VCF讀者
這個選項已經被移除的split_multiallelics變壓器。變壓器比VCF讀者更快和更準確的選擇。