磚7.1運行時的基因組學(不支持)

磚在2020年7月發布了這張照片。

磚7.1運行時的基因組學是一個版本的磚運行時的7.1(不支持)針對處理基因組和生物醫學數據進行了優化。它是一個組件的磚統一為基因組學分析平台。Beplay体育安卓版本

更多信息,包括指令創建磚基因集群,運行時看到的基因組學導遊。關於開發基因組學應用程序的更多信息,請參閱基因組學導遊

新功能

磚7.1運行時的基因組學是建立在磚7.1運行時。有什麼新信息的磚7.1運行時,看到的磚運行時的7.1(不支持)發行說明。

發瘋的轉換

現在提供了一個函數transform_loco執行GloWGR嶺回歸變換與漏掉一條染色體(火車頭)策略。分區預測表型值避免近端汙染下遊協會測試期間。的GloWGR文檔展示了新的用法。

重塑GloWGR輸出功能

現在提供了一個函數reshape_for_gwas將表型估計輸出通過從熊貓DataFrame GloWGR火花DataFrame兼容發光的全基因組關聯研究(GWAS)回歸函數。的GloWGR文檔反映了新的用法。

改進

RNASeq輸出未配對的比對

RNASeq管道現在從明星輸出未成對排列。這些以前隻投讚成成對排列。

下麵列表中包含的庫磚7.1運行時的基因組學不同於那些包含在磚7.1運行時。

包裝庫

圖書館

版本

亞當

0.32.0

GATK

4.1.4.1

Hadoop-bam

7.9.2

samtools

1.9

VEP

96年