Databricks Runtime 7.3 LTS for Genomics(不支持)

數據ricks在2020年9月發布了這張圖片。2020年10月，它被宣布為長期支持(LTS)。

Databricks Runtime 7.3 LTS for Genomics是一個版本Databricks Runtime 7.3 LTS優化處理基因組和生物醫學數據。它是Databricks基因組學統一分析平台的組成部分。Beplay体育安卓版本

重要的

此文檔已退役，可能不會更新。本內容中提及的產品、服務或技術不再受支持。

Databricks Genomics運行時已棄用。有關開放源碼的等價物，請參見reposgenomics-pipelines而且發光．作為運行時的一部分的生物信息學庫已經作為Docker容器發布，它可以從ProjectGlow Dockerhub頁麵。

有關Databricks Runtime棄用策略和時間表的更多信息，請參見支持Databricks運行時版本和支持計劃．

有關更多信息，包括為Genomics集群創建Databricks Runtime的說明，請參見基因組學導遊．有關開發基因組學應用程序的更多信息，請參見基因組學導遊．

有關從Databricks Runtime 6遷移的幫助。x到Databricks Runtime 7.3 LTS，請參見數據庫運行時7。X遷移指南．

新功能

Databricks Runtime 7.3 LTS for Genomics是在Databricks Runtime 7.3 LTS的基礎上構建的。有關Databricks Runtime 7.3 LTS中新增內容的信息，請參見Databricks Runtime 7.3 LTS發行說明。

Glow現在支持讀取BGEN文件包含未壓縮或使用zstandard壓縮的SNP塊概率數據ZSTD_compress ()函數，除了現有的支持讀取使用zlib壓縮的數據壓縮()函數。

執行變體liftOver與輝光現在高達12倍快。

寫入大文件(如VCF, BGEN和BAM)到Azure Blob文件係統現在速度快了兩倍。

所有基因組學管道現在默認使用bgzip壓縮輸出vcf。默認情況下，輸出vcf以前是未壓縮的。要對此進行配置，請更改vcfCompressionCodec的管道選項bgzf．

的腫瘤/正常管道已經從TNSeq改名為MutSeq。

以下部分列出了Databricks Runtime 7.3 LTS for Genomics中包含的與Databricks Runtime 7.3中包含的不同的庫。